ยาปฏิชีวนะมักสงวนไว้สำหรับการติดเชื้อแบคทีเรีย

ยาปฏิชีวนะมักสงวนไว้สำหรับการติดเชื้อแบคทีเรีย เนื่องจากยาประเภทนี้ไม่มีผลต่อการเจ็บป่วยที่เกิดจากไวรัส แต่บางครั้งก็ยากที่จะบอกได้ว่าเชื้อโรคชนิดใดกำลังทำงานอยู่ ตัวอย่างเช่น โรคปอดบวมอาจเกิดจากแบคทีเรีย ไวรัส เชื้อรา หรือปรสิต การรักษา การใช้ยาปฏิชีวนะมากเกินไปส่งผลให้แบคทีเรียหลายชนิดพัฒนาความต้านทานต่อยาปฏิชีวนะอย่างน้อยหนึ่งชนิด ทำให้แบคทีเรียเหล่านี้รักษาได้ยากขึ้นมาก